Eu sei que você só pode ter 4 partições primárias em um disco rígido. Mas se você estiver usando menos de 4, há um benefício/penalidade por usar partições lógicas?
Hoje, não importa se você usa partições primárias ou estendidas.
Houve momentos em que/boot tinha que ser uma partição primária, mas isso não é verdade mais. Também as encarnações anteriores do MS Windows necessitaram de instalar o Windows para uma partição primária.
Quando configurei um novo disco, faço a primeira partição primária e coloque/bota lá e coloque o resto como partições lógicas em um grande estendido, mas isso é apenas uma preferência pessoal.
Eu diria que há realmente uma penalidade se você usar partições lógicas em vez de primárias:
Então, se você tem até 3 partições, mantenha-os primários. Se você tiver 4 ou mais, use a 4ª como partição estendida e comece a usar lógicas.